הוא בוגר לימודי תיאולוגיה של במספר מוסדות כנסייתיים ברחבי העולם. בשנת 1998 נבחר מנוגיאן לסקריסטאן (כלי הקודש הכנסייתיים) הראשי של הפטריארכיה הארמנית בירושלים וב 1999 הוסמך לבישוף. בשנת 2009 הוא הועלה לדרגת כוהן פטריארכלי ובתפקידו זה פיקח על
הפטריארכיה. ב- 2013 הוא נבחר למשרת הפטריארך.

ב- 2014, קיבל הפטריארך מנוגיאן את התואר דוקטור לשם כבוד לתיאולוגיה מהסמינר התיאולוגי הכללי במנהטן, ניו יורק.